Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rhbdl2A2AGA4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rhbdl2A2AGA4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms