Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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