Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms