Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ubl3Q9Z2M6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ubl3Q9Z2M6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms