Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms