Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pdpk1Q9Z2A0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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