Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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