Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn10Q9Z0S6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn10Q9Z0S6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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