Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clip2Q9Z0H8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clip2Q9Z0H8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Clip2Q9Z0H8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip2Q9Z0H8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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