Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms