Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnnt3Q9QZ47 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms