Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nphp1Q9QY53 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 485 ms