Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Kcnip3Q9QXT8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms