Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmQ9QXG2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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