Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms