Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms