Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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