Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms