Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gfra4Q9JJT2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms