Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Pgpep1Q9ESW8 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms