Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
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Rb1cc1Q9ESK9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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