Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms