Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms