Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms