Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop7Q9DCH2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop7Q9DCH2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms