Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf6Q9DBU5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf6Q9DBU5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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