Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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