Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim23Q9DAL0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms