Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn34b2Q9D9N2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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