Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf138rt1Q9D9M9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms