Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Sec11cQ9D8V7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sec11cQ9D8V7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms