Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9D8N1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms