Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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