Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2al3Q9D4U4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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H2al3Q9D4U4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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