Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms