Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms