Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt20Q9D312 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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