Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab1bQ9D1G1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1bQ9D1G1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms