Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms