Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms