Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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