Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg12Q9CQY1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atg12Q9CQY1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms