Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf2Q9CQJ4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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