Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms