Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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