Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q9CQ90 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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