Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp2Q9CQ73 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp2Q9CQ73 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms