Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Chmp3Q9CQ10 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Chmp3Q9CQ10 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Chmp3Q9CQ10 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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