Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim3Q99PE5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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