Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms